J-Kopplungs-Gestutzte Diederwinkelanalyse Im Fettsaurebindungsprotein

Diplomarbeit aus dem Jahr 2000 im Fachbereich Chemie - Biochemie, Note: 1, Johann Wolfgang Goethe-Universitat Frankfurt am Main (Institut fur Biophysikalische Chemie und Biochemie, Abteilung Biophysikalische Chemie, Abteilung Biophysikalische Chemie), 70 Quellen im Literaturverzeichnis, Sprache: Deutsch, Abstract: In dieser Arbeit wurde eine Geometrieuntersuchung am FABP-Molekulmodel durchgefuhrt. Um 3J-Kopplungsinformation fur die Diederwinkelanalyse zu bestimmen, wurden J-modulierte [15N,1H]-COSY-Experimente durchgefuhrt. Mit Hilfe numerischer Anpassungsroutinen wurden die Signalintensitaten quantitativ ausgewertet, um sehr genaue 3J-Kopplungskonstanten zu erhalten. Diese Kopplungskonstanten wurden in Kraftfeldrechnungen als experimentelle Randbedingungen fur die phi-Diederwinkel des Proteinruckgrates berucksichtigt. Dadurch ist eine Aussage uber die Winkelverteilung und uber die zeitlich gemittelten Kopplungse#ekte im Proteinmodell moglich. Die aus der Molekulardynamiksimulation bestimmten 3J-Kopplungskonstanten wurden mit den experimentellen verglichen. Die Analyse ergab, da die den -Faltblattern zugewandten Rander der alphaII-Helixbereiche sowie zwei der zehn -Faltblattbereiche sehr exible Teilabschnitte aufweisen. Diese Arbeit konnte somit die Uberlegungen stutzen, die vor allem den exiblen Teilabschnitt zwischen der alpha-II-Helix und dem -Faltblattbereich fur die Funktion des Proteins verantwortlich machen.